Минфин напомнил, что по правилам в архиве организации должно быть не менее двух экземпляров электронных документов. Если первичку и регистры обрабатываете в единой автоматизированной информсистеме, их хранение обеспечивает она.
Однако за сохранность документов отвечает учреждение, поэтому оно само решает, как достичь нужного результата.

Вопрос: О порядке хранения организациями бюджетной сферы электронных первичных документов и регистров бухучета; о предъявлении контролирующим органам электронных документов и печати на бумажном носителе. (Письмо Минфина России от 27.05.2022 N 02-07-10/50875) {КонсультантПлюс}