Заключите дополнительное соглашение к трудовому договору и издайте приказ о временном исполнении обязанностей, указав в них размер доплаты за замещение. Это может быть как фиксированная сумма, так и процент от оклада (ст. 151 ТК РФ).

Типовая ситуация: Исполнение обязанностей временно отсутствующего работника: как оформить и оплатить (Издательство «Главная книга», 2020) {КонсультантПлюс}