Соглашение не применяется, в частности, в отношении оборонной продукции, продукции, используемой в целях защиты сведений, составляющих государственную тайну, продукции, бывшей в употреблении, лекарственных средств, медицинских изделий, а также не распространяется на правоотношения, связанные с применением санитарных, ветеринарно-санитарных и карантинных фитосанитарных мер.
Соглашение является международным договором, заключенным в рамках ЕАЭС, и входит в его право.